Zdroje pro získání dalších informací#
Název zdroje |
Odkaz |
Stručný popis |
|---|---|---|
Diskusní fórum pro software pro analýzu bioobrazu |
||
🌐 Peter Bankhead’s Intro to Bioimage Analysis |
Průvodce analýzou obrazu pro úplné začátečníky, včetně vložených otázek/odpovědí, cvičení s Pythonem a ImageJ a videí |
|
📖 Bioimage Data Analysis 40 |
Volně dostupná online učebnice představující různá témata od odborníků na analýzu Bioimage, kterou připravil Kota Miura |
|
📄 Reproducible image handling and analysis 41 |
Článek shrnující hlavní úskalí při manipulaci s obrázky a jak se jim vyhnout a vytvořit reprodukovatelné analytické pracovní postupy |
|
📄 Made to measure: an introduction to quantification in microscopy data |
Článek popisující několik běžných tříd měření prováděných v mikroskopických datech a také technické faktory, které mohou ovlivnit výsledky |
|
🌐 Metrics Reloaded |
Interaktivní průvodce výběrem správné metriky pro vaši vědeckou otázku |
|
📄 A Hitchhiker’s guide through the bio-image analysis software universe 3 |
Článek, který poskytuje návod a glosář dostupného softwaru a balíčků pro analýzu obrazu |
|
🌐 BioImage Informatics Index |
Platforma úložiště pro vyhledávání nástrojů a pracovních postupů analýzy bioobrazu na základě zvoleného problému, metody nebo softwaru |
|
🎥 Série videí iBiology Bioimage Analysis |
Video série, která představuje Bioimage analýzu, včetně přehledů zpracování obrazu, segmentace, sledování, provádění a interpretace měření, tipy a úskalí |
|
🌐 Bioimage ANAlysis Desktop (BAND) |
Přístup k virtuálním desktopům umožňující přístup k softwaru pro analýzu bioobrazu z prohlížeče |
|
🌐 Galaxy Imaging Node |
Galax node y s řadou nástrojů a pracovních postupů analýzy obrazu s otevřeným zdrojovým kódem, který usnadňuje vytváření a sdílení reprodukovatelných pracovních postupů FAIR. |
|
🌐 Školící zdroje pro analýzu obrazu |
Zdroje pro analýzu obrazu shromážděné komunitou NEUBIAS, stylizované na základě modelu The Carpentries |
|
🌐 Bioimage Analysis AwesomeList |
Kurátorský AwesomeList zdrojů týkajících se analýzy bioobrazů |
|
🌐 Bioimage Analysis Notebooks |
Kolekce notebooků Python Jupyter pro BioImageAnalysis, GPU akcelerované zpracování obrazu, bio-image data science a další |