Sledování objektů#
Co je to trackování?#
Sledování objektu nebo sledování objektů označuje schopnost odhadnout umístění objektů v pohybu od jednoho snímku videa k dalšímu. Sledování objektů v mikroskopii prakticky zahrnuje identifikaci vašich objektů v každém snímku vašeho videa a následné propojení objektů mezi jednotlivými snímky, abyste mohli identifikovat stejnou buňku, jak se pohybuje v prostoru.
📏 Jak měřit?
Existuje několik možností pro sledování objektů, jako je plugin TrackMate 20 pro FIJI, ale nastavení je poněkud složitější. Kromě pouhé identifikace objektů ve filmu/časové řadě vám sledování také umožňuje identifikovat události rozdělení (např. mitóza) a sloučení. Existuje mnoho měření, která vycházejí ze sledování, včetně prostorových měření, jako je místo, kam se objekty pohybují, měření rychlosti, ujetá vzdálenost (délka dráhy) a rychlost rozdělovacích událostí (např. mitotické události) a slučovacích událostí.
⚠️ Kde se může něco pokazit?
Pokud objekty mizí ze snímku na snímek, je obtížnější je sledovat v čase. Základem dobrých výsledků sledování je přesná segmentace. To může být obtížnější, pokud se v průběhu videa mění také tvar nebo intenzita objektů (například v důsledku bělení). Je důležité najít strategii segmentace, která bude dobře fungovat napříč snímky.
Nedostatečná snímkovací frekvence Pokud jsou objekty velmi dynamické, ale snímky nebyly pořízeny s vysokou frekvencí, může být sledování obtížné, protože se objekty mohly příliš pohybovat, než aby je algoritmus dokázal propojit mezi jednotlivými snímky. Je důležité přizpůsobit frekvenci pořizování snímků tomu, jak dynamické jsou vaše buňky nebo objekty.